アナログ入力時のオートトラック機能は、S_SVL（サウンドレベル）で設定した値をスレッショルドレベル（しきい値）として、入力の音楽信号がこの値より低い状態が2秒以上続いた場合に、装置が『曲が終了した』と判断し、次の曲の始まりでトラック番号を更新します。このため、クラッシックなどで楽章の途中に数秒間音が無くなる場合や、非常に小さい音が続く場合は装置が無音状態で曲が切り替わったと判断し、曲の途中でもトラック番号が更新されることがあります。
逆にライブ録音で曲が終了しても拍手やMCが続く場合などは、曲の切り替わりを検知できないため、オートトラック機能でトラック番号が更新されない可能性があります。

また、元のソース（音源）が、レコードやテープの場合は曲間の無音部分に傷やホコリによる”プチッ”といったノイズを音として判断したり、テープのヒスノイズのレベルが上記のS_LVL設定値を上回っている場合、常に音が出ていると判断して同様にオートトラック機能が働かない可能性があります。

オートトラック機能を正しく機能させるためには、上記のS_LVLと録音レベルの設定が非常に重要になります。一般的にレコードやテープ等のアナログ音源の録音をする場合は、S_LVLは高めの値に設定し、CD等のノイズが少ない音源を録音する場合はS_LVLの値を低めに設定することで、ポップスや歌謡曲など曲間が空いた音楽ソースは意図した場所でトラック更新を動作させることができます。　加えて録音レベルもレベルオーバーしない範囲でできるだけ高めに設定していただくことで、オートトラック機能も正しく働くようになります。　具体的な設定につきましては取扱説明書をご参照ください。

＜実際の曲数より曲番が少なくなる場合＞
S_LVLの設定が低すぎるため、本来の切り替え箇所を検知できてない可能性があります。この場合は、S_LVLを1～3段高めの設定に変更してお試しください。　これでも正しくトラック番号が更新できない場合は、マニュアルトラック（手動での曲番付）設定をお試しください。

＜実際の曲数より曲番が多くなる場合＞
S_LVLの設定が高すぎるため、本来の切り替えたい箇所以外の部分でトラック番号が更新されている可能性があります。　この場合は、S_LVLを1～3段低めの設定に変更してお試しください。　また、録音レベルが低い場合も曲番が多く付いてしまう原因になりますので、ご注意ください。　これでも正しくトラック番号が更新できない場合は、マニュアルトラック（手動での曲番付）設定をお試しください。

録音中に曲間や楽章の切り替わりなど任意の場所で、本体もしくはリモコンの「RECORD」ボタンを押すことで、録音を中断せず継続しながらトラック番号を手動で更新することが可能です。　オートトラックが正しく動作しないクラッシックタイトルやライブ盤などに有効です。